В центре сюжета сериала "Академия шпионов" - Йона Харари, агент Моссада, который после неудачной операции в Болгарии получает новое назначение. Он становится руководителем курса подготовки будущих шпионов. Чтобы отобрать самых достойных кандидатов, Йона разрабатывает сложный практикум-экзамен, где претенденты должны продемонстрировать свои навыки в условиях, максимально приближенных к реальным.
Кандидатам, которых подозревают в шпионаже для Ирана, предстоит скрыться от преследования и прибыть в назначенное время на базу Моссада. Только те, кто справится с этим заданием, получат право стать курсантами академии. Всего 13 человек проходят отбор.
В процессе обучения курсанты осваивают различные приемы работы агента: установка технических устройств для слежения, скрытое наблюдение и даже использование обольщения в целях получения информации. Те, кто не справляется с заданиями, исключаются из академии.
Однако тренировки курсантов являются лишь фоном для более серьезных событий, которые касаются тайны провала операции в Болгарии. Сериал погружает зрителя в мир шпионажа и интриг, где каждый шаг может стать последним, а каждое решение - иметь далеко идущие последствия.
