Сериал "В темной коробке" раскрывает сложные отношения пятерых друзей детства: Сатору, Аой, Рицу, Мива и Мотоаки. Их связь проверяется временем и переживаниями, которые меняют восприятие друг друга. Мива тайно влюблена в Мотоаки, но не решается признаться ему в своих чувствах. Мотоаки же, не подозревая о её чувствах, сохраняет границы дружбы. Аой встречается с Сатору, однако её самооценка падает на фоне Мивы, что порождает напряжение между ними. Рицу, будучи другом для всех, переживает из-за того, что его отношения не выходят за рамки дружеских, в то время как вокруг него развиваются более глубокие связи. Сериал исследует тонкости человеческих отношений и сложности, с которыми сталкиваются друзья на пути к взрослению, где границы между любовью и дружбой становятся всё более размытыми.