В центре сюжета сериала "Кубо не признаёт меня мобом" - старшеклассник Дзюнта Сираиси, чья незаметность в повседневной жизни достигает крайних пределов. Он настолько тих и непримечателен, что даже учителя и одноклассники пренебрегают его присутствием, словно он невидимка. Дзюнта мечтает о простых радостях молодости, но его почти полная незаметность делает это желание довольно сложным для исполнения.
Однако в этом мире без внимания появляется светлая полоса - одноклассница Нагиса Кубо. Она не видит в Дзюнте обычного "моба" (термин, используемый для обозначения незаметных и невлиятельных людей), а проявляет к нему искренний интерес. Это открытие становится началом новых возможностей для главного героя, который до этого момента привык оставаться в тени.
События сериала разворачиваются вокруг отношений между Дзюнтой и Нагисой, показывая, как даже самое незаметное "ничто" может стать чем-то значимым благодаря одному человеку. Пока не раскрыты все детали их взаимодействия и причин интереса Кубо к Сираиси, но ясно одно: его жизнь начинает меняться, и он уже не тот моб, каким был раньше.
