В мире "Судьбы: Апокриф" происходит новый виток магических войн за обладание Святым Граалем - могущественным артефактом, способным исполнить любое желание. После исчезновения реликвии и многолетних поисков клан Иггдмиллениа делает сенсационное заявление: Святой Грааль у них в руках. Они решают покинуть Лигу магов, что приводит к новому конфликту.
В центре событий оказывается две противоборствующие стороны - Красный и Черный лагеря, каждый из которых стремится заполучить Грааль для своих целей. Каждая сторона обладает собственным набором Семи Героев (Серваторов) и их Духовных Партнеров (Мастеров), которые воскрешены с помощью магического ритуала.
Сериал погружает в мир, где история переплетается с мифологией, а древние герои вновь вступают в битву за власть. Красный лагерь, поддерживаемый кланом Иггдмиллениа и обладающий Граалем, противостоит Черному лагерю, который стремится остановить их и вернуть Грааль Лиге магов.
Борьба между сторонами обостряется, когда выясняется, что Грааль может привести не только к миру, но и к катастрофе. Герои прошлого, воскрешенные для новой войны, вступают в смертельные схватки, где каждый из них обладает уникальными способностями и магическими умениями.
Сюжет "Судьбы: Апокриф" разворачивается на фоне сложных политических интриг и моральных дилемм, показывая, как стремление к власти может привести к разрушению не только врагов, но и самих участников конфликта.