В далеком будущем человечество освоило космос, но мир на границах Земли так и не наступил. Колонисты продолжают свои распри, пока неизвестный враг в мобильных доспехах не начинает атаки на земные корабли и поселения. Эти агрессоры остаются загадкой для человечества, которое называет их просто - "неизвестный враг". В одной из колоний Ован 7-летний Флит Асуно теряет мать во время нападения, но она успевает передать ему таинственное устройство.
Флит выживает и со временем становится настоящим техником. В колонии Нора он вместе с друзьями восстанавливает Гандам - легендарное оружие прошлого, используя данные из фамильного устройства для его улучшения. Гандам обретает способность к самосовершенствованию и готовится защитить свою планету от новой угрозы.
Когда враг вновь появляется на Норе, новый Гандам уже ждет его в бою. Флит становится пилотом этой мощной машины, и начинается новая глава в борьбе за выживание человечества.
