В центре истории - Цукунэ Аоно, парень, не отличающийся особой прилежностью в учебе. После провала экзаменов в старшую школу он оказывается в Призрачной Академии, куда берут без всяких ограничений по оценкам. Однако академия оказывается далеко не обычным учебным заведением: она расположена в мире, напоминающем творения Лавкрафта, где обитают существа из мифов и легенд.
Первым испытанием для Цукунэ становится встреча с Мокой, загадочной девушкой, которая падает на него прямо с неба. Она ищет друзей, и наш герой без раздумий предлагает свою помощь. В школе Цукунэ обретает новых товарищей - огр-людоеда, ведьму, оборотня и суккуб, каждый из которых пытается адаптироваться к жизни среди людей.
Однако самое необычное открытие ждет его впереди: Мока оказывается вампиром, и когда с её груди снимают крестик, она превращается в могущественную Принцессу монстров. Несмотря на все эти сюрпризы, Цукунэ остается верен своим принципам и убежден, что главное - это не внешняя оболочка, а внутренний мир человека.
Но как он сам попал в этот магический мир, где защитный барьер убивает любого смертного? Этот вопрос становится ключевым для понимания его места в новом мире и раскрытия тайны Призрачной Академии.