В центре сюжета сериала "Фантом" - столичный оперативник Стас Хабаров, чья жизнь кардинально меняется после покушения. Получив ранение в спину во время операции по аресту наркоторговца, он умирает и превращается в призрака. Перед ним встаёт выбор: покинуть мир живых или остаться, чтобы защитить свою жену Веру от неминуемой смерти за её день рождения от руки неизвестного убийцы.
Стас решает остаться и выяснить, кто стоит за его смертью, ведь только так он сможет предотвратить трагедию. Однако его невидимость для окружающих усложняет задачу - никто не видит и не слышит его. Все меняется, когда он встречает Катю, студентку, способную видеть и общаться со Стасом.
Вместе они начинают расследование, которое приводит к серии открытий о темных делах в полицейских рядах и тайнах из прошлого Хабарова. Стас должен использовать свои навыки и новые возможности призрака, чтобы раскрыть заговор и спасти Веру. Время работает против него, ведь убийца всё ближе к своей цели.