Сериал "Темные небеса" погружает зрителя в мрачный мир заговора и инопланетного влияния после событий, произошедших в Розуэлле. В центре сюжета - живой пришелец, который попадает к американским военным и раскрывает шокирующую правду: Земля уже давно является целью для колонизации таинственного инопланетного сообщества, известного как "Улей". Эти существа обладают способностью вселяться в людей с помощью имплантантов, полностью подчиняя их волю.
Военное командование решает скрыть эту информацию от общественности, однако молодой агент Лонгард не согласен с такой политикой. Его убеждения укрепляются, когда его невеста становится очередной жертвой инопланетян. Джон Лонгард проявляет несгибаемую решимость и самоотверженность, чтобы спасти любимую женщину от влияния пришельцев.
Спасение невесты приводит к тому, что количество врагов у Джона удваивается: теперь ему приходится бороться не только с инопланетянами, но и с военными, которые пытаются замять дело. Сериал следует за агентом Лонгардом в его борьбе против "Улья", где каждый шаг может быть последним, а каждое человеческое существо - потенциальным врагом или союзником.
