Время действия сериала "Мушкетеры 20 лет спустя" приходится на период политических бурь во Франции. Кардинал Мазарини, стремящийся укрепить свою власть, требует от королевы Анны имена мушкетеров, которые в прошлом мешали его планам. Королева называет имя д’Артаньяна, и кардинал поручает ему найти Атоса, Портоса и Арамиса, надеясь привлечь их на свою сторону.
Д’Артаньян успешно находит Портоса, который, несмотря на своё нежелание вмешиваться в политику, присоединяется к нему. Однако Атос и Арамис уже вовлечены в Фронду - движение против кардинала Мазарини. Это приводит к тому, что бывшие друзья оказываются по разные стороны баррикад.
Конфликт между героями обостряется, когда их пути пересекаются вновь. Ставки высоки: будущее Франции и личные отношения друзей висят на волоске. Д’Артаньян, Атос, Порос и Арамис вынуждены принять решения, которые определят не только их судьбы, но и исход борьбы за власть в стране.
Сериал является продолжением истории о мушкетерах, начатой в фильме "Д’Артаньян и три мушкетёра", и основан на романе Александра Дюма-отца "Двадцать лет спустя". События разворачиваются двадцатилетие после знаменитых приключений героев, когда Франция переживает новые испытания.