В центре сюжета сериала "Таинственный остров" - группа американцев, оказавшихся в эпицентре Гражданской войны между Севером и Югом США 1865 года. Капитан Сайрус Хардинг, командир северян, попадает в плен к южанцам, но ему удается сбежать вместе с военным корреспондентом Гидеоном Спилетом, семьей Пенкрофтов и чернокожим солдатом Нэбом Брауном. Их спасение от плена происходит необычным способом - они улетают на воздушном шаре. Однако их полет обрывается из-за разыгравшейся бури.
Эта история тесно переплетена с романом-робинзонадой Жюля Верна "Таинственный остров", который является продолжением его знаменитых произведений "Дети капитана Гранта" и "Двадцать тысяч льё под водой". В книге описывается судьба пятерых американцев, которые после крушения воздушного шара оказываются на необитаемом острове в Тихом океане. Их приключения начинаются с момента падения на остров, который находится в Южном полушарии.
Персонажи сериала, как и герои романа Верна, сталкиваются с необходимостью выжить в условиях полной изоляции от цивилизованного мира. Они должны использовать свои знания и навыки для создания удобств жизни, обеспечения себя пищей и защитой от опасностей острова. В романе детально описывается их жизнь на острове, разделенная на три части: "Крушение в воздухе", "Покинутый" и "Тайна острова". Каждая глава открывает новые аспекты выживания и исследования тайн этого загадочного места.
Сериал следует этой классической истории о мужестве, дружбе и интеллекте, которые помогают героям преодолеть трудности и раскрыть тайны острова. Несмотря на то что сериал основан на романе Верна, он адаптирован для современной аудитории с учетом реалий 1995 года, когда и был снят.