В центре сюжета сериала "Загадка Пифагора" - таинственное убийство известного математика Лунгина, которое происходит в номере отеля. В ходе расследования выясняется, что из сейфа убитого пропадает ценный бриллиант. Перед смертью Лунгин поделился с группой студентов профессора Ольги Барковской секретом: код сейфа состоит из десяти цифр, имеющих отношение к Пифагору.
Студенты становятся ключевыми фигурантами в деле об убийстве, так как на каждого из них указывают определенные улики. Старший следователь Светлана Карташова берется за расследование и пытается разобраться в запутанной истории. Однако Ольга Барковская, используя свои знания в математике, начинает собственное расследование.
Проанализировав числа кода сейфа через призму теоремы Пифагора, профессор обнаруживает важную деталь, которая может привести к разгадке преступления. Эта ниточка обещает вывести на след настоящего убийцы и вора бриллианта, оправдав тем самым студентов.
Сериал "Загадка Пифагора" сочетает в себе элементы детектива и математической головоломки, где каждый эпизод приближает к разгадке преступления, а математические знания становятся ключом к решению загадки.