В центре сюжета - Михару Рокудзё, подросток с необычным даром Сотворения, который превращает его жизнь в череду опасностей. После утраты родителей он старается держаться в стороне от людей, боясь причинить им вред своим талантом. Ведь именно этот дар делает его кандидатом на титул владыки Набари - мира скрытых ниндзя.
Михару становится объектом охоты для клана Ига, стремящегося использовать его способности для своих целей. Вокруг него формируется группа защитников: учитель Кумохира и двое одноклассников - умный Койити и эксцентричная Симидзу, оба обладающие навыками боевых искусств.
Параллельно учебе в школе, Михару и его друзья участвуют в битвах, преследуют и бегут от врагов. В то же время он помогает бабушке в её окономиячной. Постепенно Михару осознаёт, что для выживания ему предстоит пройти сложный путь, на котором его ждут новые испытания и открытия.