В центре сюжета сериала "Версия 2" - Желвис, следователь, известный своей непредсказуемостью и принципиальностью в работе. Его действия зачастую становятся настоящим испытанием для коллег, ведь предсказать их почти невозможно. Например, он без колебаний задерживает главу местной администрации Мурашко прямо в его кабинете за уклонение от дачи показаний.
Ситуацию спасает лишь вмешательство руководителя Желвиса Олега Петракова, который предлагает ему перевестись в новое подразделение областного следственного комитета. Желвис соглашается, несмотря на свою независимость, ведь он нуждается в поддержке Петракова так же, как тот ценит его дедуктивные способности.
На новом месте работы Желвису поручают расследование исчезновения Шахновского, мужа его бывшей одноклассницы и первой любви Царёвой. Сначала он отказывается браться за это дело, но давление начальства оказывается сильнее. В помощь ему приставляют практиканта Никиту Тюрина, и вместе они начинают расследование.
Первые улики указывают на возможное преступление: в лесу найдена брошенная машина Шахновского, а рядом с ней - его труп. Желвис, столкнувшись лицом к лицу со своим прошлым, должен разгадать эту загадку, несмотря на личные переживания и сложности, которые возникают по ходу расследования.