Трансформеры: Войны гештальтов - это продолжение вековой вражды между автоботами и десептиконами, но уже в новой эре Кибертрона. Прошли десятилетия с тех пор, как закончилась Великая война, однако мир на родной планете трансформеров так и не установился окончательно. В отсутствие Оптимуса Прайма и Мегатрона, которые когда-то были лидерами конфликта, власть перешла к новым персонажам, но это не привело к долгожданному миру.
Возникают новые угрозы - гештальты начинают междоусобные войны, что становится поводом для испытания опасного оружия. Катастрофа на Земле, где расположен Каминус, приводит к тому, что совет Кибертрона принимает решение о мести виновникам хаоса.
Оптимус Прайм оказывается изгнанным с родной планеты, в то время как Старскрим обретает невиданную ранее мощь и власть благодаря древнему оружию. Однако его намерения далеки от оборонительных - он использует силу для своих целей, что вновь поджигает пламя войны между двумя мирами.
Таким образом, начинается новая глава в истории трансформеров, где старые враги и новые союзники сталкиваются в борьбе за выживание и контроль над могущественными технологиями.