В далёком будущем человечество пережило войну с враждебной расой гигантов Зентради, после чего, на грани вымирания, решило искать новые миры для колонизации. В 2059 году корабль "Макросс Фронтир" является частью Иммиграционного Флота, который направляется к центру галактики в поисках нового дома. На борту корабля разворачивается бурная жизнь: концерты звёзд, романтические истории и повседневные заботы.
Внезапно мирное существование нарушается угрозой новой атаки. Поп-звезда Шерил Ном приезжает на борт с концертом, когда внезапно поступают тревожные сообщения о приближении вражеского флота. Ситуация обостряется, и объявляется боевая тревога. Несмотря на все усилия военных, корабли противника неумолимо движутся к гражданским судам.
Герои сериала сталкиваются с необходимостью бороться за выживание, их жизни переплетаются в сложной сети отношений, где каждый выбор может иметь роковые последствия. "Макросс Фронтир" - это история о поиске нового дома среди звёзд, о любви и дружбе на фоне космической войны и постоянных угроз, которые подстерегают человечество в его бесконечном путешествии по галактике.
