Сериал "Кафедра" рассказывает о жизни и работе научно-академического коллектива в институте. В центре сюжета - профессор Завалишин, выдающийся ученый и заведующий кафедрой, который приходит к выводу о том, что его научный вклад исчерпан из-за преклонного возраста. Его отход от науки усугубляется личными переживаниями после смерти жены, в результате чего он покидает преподавательскую деятельность.
После кончины Завалишина руководство кафедрой принимает на себя профессор Флягин. Он стремится к улучшению работы коллектива, однако обнаруживает, что не обладает нужными качествами для управления людьми и в итоге отказывается от своей должности.
В противостояние с Флягиным и другими представителями научного сообщества вступает доцент Нина Игнатьевна Осташева - талантливый ученый и мать троих детей. Она возглавляет комиссию по изучению наследия Завалишина, но выясняется, что в последние годы его жизни он не создал ничего нового. Чтобы сохранить репутацию учителя, Осташева включает в посмертный сборник своих научных работ, выдавая их за труды покойного профессора.
Этот сериал затрагивает темы увядания творческих сил, личных трагедий и моральных дилемм в академической среде.