В центре сюжета сериала "Мятеж" - драматическая история Лизы Журавлёвой, которая в 1921 году оказывается задержанной ЧК по подозрению в организации Ярославского мятежа. Её арест связан с необходимостью защиты своего маленького сына, и Лиза готова рассказать всё, что известно следствию. Однако её показания превращаются в историю о любви и страданиях на фоне Первой мировой войны, революции и гражданской войны в России.
Лиза вспоминает свою любовь к курсанту Сычёву, которая была обречена с самого начала из-за социального неравенства. Также она рассказывает о принудительном браке с капитаном Крушевским, человеком распутным и жестоким. Эти воспоминания раскрывают сложные отношения между персонажами и показывают, как исторические события влияют на личную жизнь людей.
Следователь Воронов, ведущий дело Лизы, начинает переосмысливать свои взгляды на революцию и справедливость. Его представления о происходящем в стране меняются под влиянием рассказа женщины, которая пережила множество испытаний и потеряла многое в результате исторической мясорубки.
Сериал "Мятеж" погружает зрителя в атмосферу революционного времени, показывая, как личные трагедии переплетаются с политическими событиями, и заставляет задуматься о том, что такое настоящая свобода и справедливость.