В центре сюжета сериала "Что случилось с секретарём Ким?" - история отношений между вице-президентом крупной компании Ли Ён-джуном и его секретарем Ким Ми-сой. Ён-джун, обладающий не только внешней привлекательностью, но и острым умом, известен своим высокомерием. Он привык к тому, что все вокруг подчиняются его воле, включая свою преданную помощницу, которая безупречно справлялась со своими обязанностями на протяжении нескольких лет.
Однако внезапно Ким Ми-со принимает решение уйти с работы, и это решение заставляет Ён-джуна задуматься. Ведь если его верный секретарь покидает свой пост, значит, в их отношениях что-то пошло не так. Ли Ён-джун начинает собственное расследование, чтобы выяснить причины столь резкого шага Ми-сой и понять, как он мог упустить важные моменты в их взаимодействии.
По мере развития событий становится ясно, что между ними возникло нечто большее, чем просто рабочие отношения. Ён-джун начинает видеть в своей помощнице не только профессионала, но и женщину с собственными желаниями и стремлениями. Их взаимоотношения переходят на новый уровень, где высокомерие уступает место взаимопониманию и уважению.
Сериал исследует темы любви и карьеры, показывая, как личные чувства могут пересекаться с профессиональными обязанностями. Зрители становятся свидетелями того, как два человека из разных социальных слоев пытаются найти общий язык и понять друг друга в условиях строгих корпоративных правил и собственных предубеждений.