В центре сюжета сериала "Девять пазлов" - Юн И-на, девушка, которая десять лет назад потеряла опекуна, своего дядю, убитого в собственном доме. Рядом с телом обнаружили фрагмент пазла, а сама И-на стала главным подозреваемым из-за того что была единственной свидетельницей преступления. Несмотря на отсутствие доказательств, дело так и осталось нераскрытым.
С тех пор прошло много времени, Юн И-на выросла и теперь работает профайлером, завоевав уважение коллег своей профессиональностью. Её жизнь меняется, когда она получает второй фрагмент пазла, после чего происходит новое убийство. В расследовании этого преступления ей приходится сотрудничать со следователем Кимом, который ранее вел дело о смерти её дяди и до сих пор сомневается в её невиновности.
И-на и Ким оказываются вовлечены в сложную игру, где каждый новый пазл приводит к новым убийствам. Прошлое И-ны начинает влиять на настоящее, а каждое новое доказательство может как подтвердить её непричастность, так и усилить подозрения. Работая вместе, они пытаются разгадать тайну пазлов, которая, возможно, приведёт к раскрытию давно забытого преступления и поможет восстановить доброе имя И-ны.
