В мультфильме "Отчаянные псы" двое исследовательских лаборатории - Ровф, взрослый лабрадор с циничным взглядом на жизнь, и оптимистичный фокстерьер по кличке Сниттер. Они становятся героями неожиданного побега из своей тюрьмы. В ходе своего бегства псы случайно освобождают вирус чумы в окружающий мир, что становится началом их новых приключений за пределами знакомых стен.
На свободе они сталкиваются с суровой реальностью дикой природы и недоверием людей, которые видят в них только угрозу. Несмотря на все трудности, Сниттер сохранил надежду найти доброту и дом, о котором мечтал после потери своего прежнего хозяина.
В их путешествии они встречают верного союзника - лиса Тода, который помогает им выжить среди опасностей дикой местности. Однако мир за стенами лаборатории оказывается не менее опасен для беглецов: люди, обеспокоенные возможной эпидемией чумы, начинают охоту на псов.
Сюжет мультфильма сосредоточен вокруг борьбы двух собак за выживание в жестоком мире людей и природы, где каждый шаг может стать последним. В центре истории - не просто побег от преследования, но и поиск смысла существования и места под солнцем для тех, кто был лишен свободы и доверия окружающих.