В центре сюжета аниме "Паразит: Учение о жизни" - школьник Синъити Идзуми, чья жизнь кардинально меняется после встречи с паразитом. Эти существа способны проникать в мозг человека и полностью подчинять его себе, но Синъити становится носителем одного из них по нелепой случайности - паразит не смог занять место в его голове и обосновался в руке. Это дает юноше уникальные способности, но также превращает его жизнь в непрекращающуюся борьбу за выживание.
Синъити вынужден скрывать своего нового "соседа" от окружающих, ведь паразиты охотятся не только на людей, но и друг на друга. Его противник - Мизуки Нэмура, девушка-паразит с необычайной силой воли, которая стремится уничтожить Синъити, видя в нем угрозу своему виду. Их противостояние становится ключевым моментом истории, где каждый из них пытается найти свое место в мире, где человечество и паразиты ведут скрытую войну.
Синъити осознает, что его новый "друг" по имени Мэлис требует пищи - человеческих мозгов. Парень старается контролировать свои инстинкты и не поддаваться желанию убивать, пытаясь сохранить свою человечность. В то же время он сталкивается с другими паразитами, каждым из которых движет своя цель: одни хотят уничтожить человечество, другие - сосуществовать.
История "Паразита" затрагивает глубокие философские вопросы о природе человека, его моральных выборах и способности к самопожертвованию. Синъити Идзуми становится героем, который не только борется за свою жизнь, но и пытается понять, что значит быть человеком в мире, где граница между человеком и паразитом стирается.
