В центре истории мультфильма "Секрет Н.И.М.Х." находится умная и отважная полевая мышь по имени Миссис Бризби, которая сталкивается с серьезной проблемой: её домик находится под угрозой сноса фермером, который планирует расчистить землю для засева. В поисках решения она обращается к своим соседям и друзьям - хитрому ворону, мудрому филину и группе необычайно умных крыс.
Миссис Бризби узнает о таинственном сообществе крыс, обитающих в лесу неподалеку, которые обладают удивительными способностями благодаря экспериментам секретной лаборатории НИМХ. Эти крысы когда-то были обычными лабораторными животными, но после бегства из заточения они обрели знания и силу, научившись использовать электричество и создав себе безопасное убежище.
С целью спасти свой дом и обеспечить будущее своим детям, Миссис Бризби отправляется в путешествие к крысам. Она проходит через множество испытаний и опасностей, включая встречу с жестоким котом по кличке Толстый Том. По прибытии она убеждает крыс помочь ей переместить её тяжелый дом на безопасное место.
В ходе своего приключения Миссис Бризби открывает для себя тайны НИМХ и узнаёт о моральной цене, которую приходится платить за обретение необычных способностей. Фильм исследует темы ответственности, выбора и последствий научных экспериментов над живыми существами.
"Секрет Н.И.М.Х." - это история о материнской любви и смелости маленького существа, которое готово на всё ради своих детей. Миссис Бризби становится примером того, как сила духа и вера в себя могут преодолеть любые препятствия.
