Фильм "Покушение на Россию" представляет собой документальное расследование событий осени 1999 года в России, когда произошли взрывы жилых домов. Особое внимание уделяется инциденту в Рязани, который, по версии создателей фильма, мог быть попыткой ФСБ спровоцировать теракт для последующего обвинения в этом чеченских сепаратистов. Однако официальная версия утверждает, что это были антитеррористические учения.
В фильме звучат свидетельства различных людей: сотрудник милиции, который обнаружил следы гексогена в подозрительных мешках, телефонистка, заявившая о перехваченных ею разговорах с упоминанием "штаб-квартиры ФСБ", а также жильцы дома, утверждающие, что обстановка была реальной и не учебной. В картине также приводятся заявления представителей власти, включая глав МВД и ФСБ.
Фильм основан на книге Александра Литвиненко и Юрия Фельштинского "ФСБ взрывает Россию" и использует материалы телекомпании НТВ. Он предлагает зрителям альтернативную версию событий, вызывая вопросы о том, что действительно произошло в те осенние дни 1999 года.